El Paisaje de Microbiodiversidad del Río Apatlaco constituye una aproximación descriptiva de la composición microbiológica de una de las microcuencas más representativas del estado de Morelos. Pretende democratizar el acceso a la información respecto a las actividades científicas que desarrollan los investigadores, como parte del enfrentamiento a la crisis de los recursos hídricos, como son la contaminación antropogénica y la pérdida de biodiversidad. El contenido de la web reposa a la sombre del proyecto: Descifrando nuevos paisajes de microbiodiversidad a nivel de especie, por deconvolución metagenómica de mapas de probabilidad de contacto a nivel de cromatina. Perteneciente al Convocatoria Ciencia de Frontera -2019-, bajo el Programa Presupuestario F003 del Consejo Nacional de Humanidades Ciencia y Tecnología (CONAHCYT). Su ejecución fue impulsada por investigadores y estudiantes en el Instituto de Biotecnología de la Universidad Nacional Autónoma de México (IBT-UNAM) entre los años 2020-2023. Esta descripción está integrada por cinco elementos que hemos considerado fundamentales para contribuir al conocimiento del estado de la cuenca: Taxonomía, Especies Relevantes y su Diversidad, Genomas, Características Físico-Químicas y Especies con Potencial Infectocontagioso. Conjeturamos que este trabajo permitirá conocer cómo se estructuran las poblaciones microbianas dentro del río bajo presión ambiental, e identificar probables especies asociadas a la contaminación e inferir sus orígenes, así como proponer alternativas de tratamiento.
Contacto: ayixon.sanchez@ibt.unam.mx
Dra. Luz de María Bretón Deval: ColaboradoraContacto: luz.breton@ibt.unam.mx
Dr. Maikel Gilberto Fernández López. Colaborador invitadoContacto: fmaikel44@gmail.com
Lizbeth Hernández Jaimes (Instituto de Investigacion de Ciencias Basicas y Aplicadas, Licenciatura en Ciencias, UAEM)
Erick Alejandro Sánchez Salazar (Licenciatura en Biología Experimental, Universidad Autónoma Metropolitana)
Isis Airam Vázquez Balderas (Ingeniería en Biotecnología, Universidad Politécnica del Estado de Morelos)
1. Bases de datos de referencia para taxogenómica microbiana:
https://github.com/ayixon/Mash-sketched-reference-databases
2. RaPDTool: Una multiplataforma para análisis rápido de metagenomas:
https://github.com/ayixon/RaPDTool